Внутри святилища находилась небольшая роща лавровых деревьев и «священный» водный источник. В Древней Греции лавр считался священным растением Аполлона. В основе столь трепетного отношения к лавру лежал миф об Аполлоне и нимфе Дафне. Согласно ему, сладострастный Аполлон твердо вознамерился овладеть нимфой. Но когда он ее уже настиг, нимфа, давшая обет целомудрия, воззвала к своей матери, богине Гее, и та превратила ее в лавровое дерево. В память о ней Аполлон сплёл из веток лавра венок, который стал его непременным атрибутом. Отсюда — лавровый венок либо ветвь, получившие впоследствии значение символа триумфа. Хотя, если следовать описанным в мифе событиям, это, скорее, красивое прикрытие неудачи.

С самого начала отправление культа Аполлона на этом месте взяла на себя местная семья по имени Бранхиды. Свое право играть ключевую роль в организации священнодействий они связывали с тем, что основатель их рода, по имени Бранхид, был наделен способностью к прорицанию самим Аполлоном. Согласно одной из легенд, так любвеобильный Аполлон отблагодарил молодого пастуха Бранхида за любовные утехи.

Бранхиды активно рекламировали унаследованные от основателя рода способности к прорицанию, и святилище стало привлекать растущее число жаждущих получить советы по важным жизненным делам.

Уже неоднократно упоминавшийся мною лидийский царь Крёз, являвшийся большим поклонником греческой культуры, пожертвовал святилищу значительную денежную сумму, на которую здесь, примерно в 560–550 гг. до н. э., был сооружен храм ионического ордера, размерами 85x38 м. Как утверждают археологи, это был диптер — храм с двумя рядами колонн с каждой из сторон. Исторические свидетельства говорят, что храм имел 112 колонн, что уже тогда делало его одним из весьма значительных сооружений греческого мира.

Во внутренней части храма была установлена бронзовая статуя Аполлона с маленькой фигуркой оленя в одной руке, и луком в другой (точнее — не луком, а фрагментом его центральной части в руке бога). Автором статуи считался скульптор Канак из полиса Сикион (северо-восток Пелопоннеса), живший в конце 6 в. до н. э. Изображения этой скульптуры можно видеть на монетах города Милета того периода. Канак был весьма прославленным скульптором в тогдашнем греческом мире, автором большого числа скульптур из бронзы, золота, мрамора, дерева, слоновой кости. В Британском музее есть экспонат под длинным номером 1824,0405.1. Считается, что это копия статуи Канака, которая стояла в старом храме Аполлона в Дидиме.

Если в Дельфах паломники задавали свои вопросы оракулу устно, то здесь они были обязаны подать свои вопросы только в письменной форме. Собрав эти вопросы, главный жрец, происходивший обязательно из рода Бранхидов, пройдя через процедуру поста и очищения, садился возле священного источника и, войдя в транс, издавал звуки, которые другие жрецы из семьи Бранхидов потом излагали в качестве связанного текста в стихотворной форме. Как и в случае с Дельфийским оракулом, Дидимейский оракул чаще всего давал весьма расплывчатые, двусмысленные ответы на заданные вопросы, избегая, таким образом, ответственности за возможные неудачи тех, кто следовал полученным ответам.