С целью расширения восстания Ли Цзы-чэн предпринял поход в провинцию Хубей, где ему удалось овладеть крупным центром г. Сиань. Здесь произошло временное объединение с войсками Чжан Сянь-чжуна, который, однако, вследствие разногласий с Ли Цзы-чэном вскоре ушел в провинцию Хэнань, овладев ее столицей г. Чанша. Затем Чжан Сянь-чжун двинул свои отряды в провинцию Сычуань, превратив г. Чэнду в свой опорный пункт. Несмотря на успешные действия повстанцев, отсутствие единства в их командовании приводило к дроблению сил, эксцентричности их наступления и в конечном счете к ослаблению.

Ли Цзы-чэн и его ближайшие помощники начали создавать аппарат новой государственной власти и осуществлять реорганизацию вооруженных сил повстанцев.

Центральный аппарат управления состоял из государственного совета в составе трех человек и шести управлений, в том числе военного управления. Создавались и местные органы власти. Личный состав государственного аппарата комплектовался крестьянами и ремесленниками, принимавшими участие в восстании. Привлекались и некоторые шэньши, сочувствовавшие и помогавшие восставшим.

Сущность реорганизации вооруженных сил повстанцев заключалась в их централизации и в упразднении организационного многообразия. По сообщению О. Мальи, под командованием Ли Цзы-чэна находилось 600 тыс. кавалеристов и 400 тыс. пехотинцев. Данные, надо полагать, преувеличены. Лучшая часть войск комплектовалась мужчинами в возрасте от 15 до 40 лет. Каждый воин имел 2–4 лошади и 10 человек обслуживающего персонала – для ухода за лошадьми, переноски грузов и приготовления пищи.

Высшее командование осуществляла группа военачальников (кузнец Лю Цзун-минь, поэт Ли Янь, Чжан Син, Ли Шуанси и др.) во главе с Ли Цзы-чэном, которая фактически являлась военным советом, где обсуждались военные вопросы и принимались решения.

Все силы восставших были сведены в пять больших соединений, насчитывавших около 60 тыс. пехотинцев и кавалеристов. Эти соединения возглавляли 20 военачальников. Центральное соединение являлось самым многочисленным. Оно состояло из 100 частей (отрядов), которыми командовали 8 высших военачальников. В остальные соединения входило по 30 частей во главе с тремя военачальниками в каждом соединении. Часть (отряд) состояла из 100–150 пехотинцев, 50 кавалеристов и обслуживающего персонала, также принимавшего участие в бою. Таким образом, организованные силы повстанцев достигали 500–600 тыс. человек.

Командование повстанцев большое внимание уделяло внедрению воинской дисциплины, при этом важную роль играл личный пример военачальников. В быту Ли Цзы-чэн не отличался от рядового солдата, того же самого он требовал и от всех командиров отрядов. За стяжательство виновных казнили. В личной собственности не разрешалось иметь золото и серебро. Трофеи распределялись среди населения и частично выдавались в виде наград особо отличившимся воинам и командирам. Характерны высокая требовательность и исполнительность личного состава повстанческих войск. Решение совета командиров и приказы каждого из них выполнялись беспрекословно.