Первоочередной заботой Ротана-генерала стало продолжение организаторского труда и подготовки, которым положил начало Фортис. Особенно решительно он добивается того, чтобы два полных года новициата и третья пробация проходили в нормальных условиях, которые бы обеспечивали их полную эффективность. Он также возобновляет обычай посланий, адресованных всему Обществу, чтобы направлять и укреплять его духовную жизнь, и ни один генерал до него не применял столь широко это средство поддержки единения среди своих монашествующих в духе их подлинного призвания[1073]. Уже в 1830 г. он пишет о той любви, какую иезуиты должны питать к Обществу. Он решительно отвергает любовь, жаждущую лишь численного роста ордена без подобающей заботы об основательной подготовке новобранцев, любовь всецело человеческую, которая видит в нем могучую и блистательную организацию, кичась его достижениями и похвалами и завидуя успехам и славе других. И, напротив, он проповедует глубоко божественную любовь, основанную, по словам св. Игнатия[1074], на взаимном обмене подлинными благами, на том, что монашествующие получают от ордена: цели, средствах, преданности Святому Престолу, духовных и апостольских традициях, – и на даре, который они приносят со своей стороны, всецело посвящая себя служению общему делу, а через него – славе Божией. В сохранившихся наставлениях Ротана не многие идеи подчеркиваются также настойчиво, как тот глубоко смиренный характер, какой должна сохранять преданность иезуитов своей монашеской семье, смирение, пример которого он подавал всегда первым в своих отношениях с другими орденами: известно, сколь самоотверженно он содействовал о. Лакордеру и дому Геранже в деле монашеского возрождения.

В 1883 г. он пишет важнейшее письмо о стремлении учредить миссии в далеких странах, особенно среди неверных, об обновлении того миссионерского духа, который был неотъемлемой частью их наследия и, как мы видели, важнейшей характерной чертой духовной жизни Общества. В этом письме он намечает полную программу миссионерских дел, показывая, что поле деятельности открыто, пробуждая святые желания и апостольские устремления, призывая глав провинций к щедрости в этих делах, напоминая о необходимости соответствующей подготовки и качествах, прежде всего духовных, необходимых для такого миссионерского служения среди язычников. При Фортисе некоторые отцы были посланы в Северную Америку и на острова Эгейского моря, но связь с великими миссиями к народам неверных не была еще восстановлена. Поэтому обязанность вновь широко раскрыть это поле деятельности опять же легла на Ротана[1075]: в 1831 г. в Сирии, 1834 – в Калькутте, 1837 – в Мадурае, 1841 – в Нанкине, 1844 – на Бурбоне и Мадагаскаре, 1848 – в Австралии, 1852 – в Кайенне. Параллельно Общество утверждается в Америке: в 1836 г. – в Аргентине, затем в Бразилии, в Чили, в Колумбии и на севере, среди индейцев Скалистых гор, благодаря знаменитому о. Де Смету.